Instytut Tertio Millennio został założony w 1996 roku przez dominikanina Macieja Ziębę OP, a jego powstanie było związane z ogłoszeniem przez Jana Pawła II Listu Apostolskiego Tertio Millennio Adveniente (1994).

W tym dokumencie Papież sformułował wezwanie do przygotowania na czas Wielkiego Jubileuszu Roku 2000.
Powtarza się dziś w świecie – pisał we wspomnianym Liście – sytuacja z ateńskiego Areopagu, na którym przemawiał św. Paweł. Tych "areopagów" jest dziś wiele i są bardzo różne. Są to wielkie tereny współczesnej cywilizacji i kultury, polityki i ekonomii. Im bardziej Zachód odrywa się od swych chrześcijańskich korzeni; tym bardziej staje się terenem misyjnym, w znaczeniu wielorakich "areopagów" (TMA 57).

Jedną z inicjatyw Instytutu Tertio Millennio – jednocześnie odpowiedzią na nauczanie papieskie  są coroczne Szkoły dla maturzystów, studentów i doktorantów. To unikalne kilkudniowe seminaria poświęcone nauczaniu społecznemu Kościoła i aktualnym wydarzeniom religijnym, kulturalnym i politycznym. Szkoły skierowane są zarówno do studentów i doktorantów. Na formułę Szkoły składają się seminaria dyskusyjne oraz wykłady zaproszonych gości – ludzi Kościoła, nauki, kultury i polityki. Wśród wykładowców znaleźli się już  m. in. Władysław Bartoszewski, Jan Krzysztof Bielecki, Ryszard Legutko, Krzysztof Zanussi. Do tej pory odbyło się 27 Szkół.

Ty razem organizowana jest specjalna Szkoła Regionalna dla środowisk akademickich Polski Zachodniej, w tym szczególnie Poznania i Wrocławia. Szkoła „Młodzi w wielkim mieście. Służba czy kariera?” skierowana jest do studentów wybranych po wcześniejszej aplikacji, a jej motywem przewodnim jest samorządność, udział obywateli w życiu ich miast i regionów. Współczesne problemy analizowane są w duchu etyki i społecznego nauczania Kościoła, szczególnie dziedzictwa Jana Pawła II.

Celem Szkoły Regionalnej jest rozbudzenie refleksji nad indywidualnym zaangażowaniem w życie społeczne, kulturalne i polityczne  w poczuciu odpowiedzialności za dziedzictwo minionych pokoleń.